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國土防空與航天部隊司令部是一個軍事行政和作戰指揮相結合的機構，包括司令部、政治部、後勤部、裝備部、國土防空部隊總部、航天部隊總部。在平時國土防空部隊總部直接指揮全國甚至全聯盟的戰略防空戰區，但是在戰爭爆發後，中國本土和華約組織分散在三大洲的其他成員國將被劃分為若干個軍區級單位。戰術、戰役性的國土防空部隊將劃歸所在地區軍區級單位指揮，而戰略性質的防空力量（戰略轟戰截擊機、彈道飛彈防禦系統）和航天部隊仍然由防空軍司令部統一指揮，直接由總參謀部下達作戰命令。

也就是說，人民軍在亞洲地區（包括本土）的八個軍區和西亞、歐洲、非洲地區的五個戰略叢集都是大軍區級單位，他們與陸軍司令部、海軍司令部、空軍司令部、戰略火箭部隊司令部、國土防空與航天部隊司令部是完全平級的。只是五大軍種司令部（除戰略火箭部隊外）主要是和平時期的軍事行政工作，而十三個大軍區才是平時訓練、考核及戰時指揮具有真正實權的作戰指揮部門。

需要說明的是，由於人民軍戰略火箭部隊和國土防空與航天部隊的作戰任務特殊，他們的指揮權全部集中在軍種司令部手中。因此，八個軍區和五個戰略叢集的司令部在戰爭時期只能直接指揮陸軍、海軍和空軍的相應部隊，各軍區司令部要在取得更高一級授權（最高領袖親自批准）後，才能指揮戰術核武器部隊和戰區性國土防空部隊。

在冷戰中，中美雙方對峙這樣的新國際形勢下，總體態勢就是中國佔據著亞洲，同時非洲的東部及南部、幾乎整個印度洋、西太平洋大部分、歐洲東部地區也成了中國的勢力範圍。

為此，在中國的國土上（包括後世的西伯利亞）以及東亞、東南亞、南亞等固有的絕對勢力範圍內劃定了軍區，換句話說就是將整個亞洲劃分為八個大軍區。而在二戰中新拓展的勢力範圍（即東歐、西亞和非洲東部、南部地區）組建五個戰略叢集。

北京軍區：司令部在北京，所轄區域是內地的華北地區、內蒙古地區、西北地區東部、江淮北部等地區。

南京軍區：司令部在南京，所轄區域是華東地區、中南地區、華南地區（包括海南、臺灣）、琉球群島、馬裡亞納群島等地區，司令部位於寧波的西太平洋艦隊也歸該軍區管轄。

蘭州軍區：司令部在蘭州，所轄區域是西南地區（包括西藏地區）、西北地區（除新疆之外）。

新疆軍區：司令部在烏魯木齊，所轄區域是整個新疆地區、蒙古高原（後世貝加爾湖以西）一直到裡海沿岸包括整個中亞地區。

瀋陽軍區：司令部在瀋陽，所轄區域是東北地區、朝鮮、日本群島、整個興安嶺地區（包括庫頁島），司令部位於海參崴的北太平洋艦隊也歸該軍區管轄。

北方軍區：司令部在定北（原來蘇聯的新西伯利亞），所轄區域是整個貝加爾湖以西的西伯利亞地區。

東南軍區：司令部在獅城（新加坡），所轄區域是中南半島地區、馬來群島地區、整個南中國海、索羅門群島、巴布亞紐幾內亞，司令部位於獅城的南太平洋艦隊也歸該軍區管轄。

遠東軍區：司令部在撫遠，所轄區域是整個貝加爾湖以東的西伯利亞地區和遠東至北冰洋的沿海地區。

在東亞、東南亞、南亞、西亞、非洲、東歐、東南歐地區，人民軍派出了大量的訓練人員和大批顧問團。正是由於他們的存在，中國得以有效控制華約組織各個成員國的所有武裝力量。為此，人民軍特意設立了華約武裝力量總參謀部，統一協調指揮成員國部隊。因此，這些部隊的指揮權在平時不歸各個軍區所有，只有在戰時軍區一級指揮機構才可與武裝力量聯合司令部協調指揮特定戰區內的華約組織所有的武裝力量。

在非洲、東歐